5E全自动智能存查样系统是基于自动化立体库的原理设计，主要由硬件及软件两大部分组成。硬件系统主要由组合式柜架系统、智能机器人、输送系统、煤样检测系统、功能附件系统（照明、视频监控、环境监控）组成。软件系统主要由运动控制系统、存查库数据信息管理系统、界面系统、权限管理系统组成。第二代全自动样品存查库系统既可单独用于对存查样经行全自动管理，也可于与全自动制样系统经行配套，并与输送系统等进行组合，可以实现采样、制样到化验室的全自动化过程，可实现从采制到化验的全程无人值守过程。系统可通过传送带与全自动制样系统对接，将全自动制样产生的6mm全水分样、3mm存查样、0.2mm一般分析样自动传送到全自动样品存查库系统进料口，实现3mm存查样的存查管理，6mm全水分样和0.2mm分析样的转运及暂存管理；并可与电厂的燃料管控系统实现信息流的无缝式对接。